如何在Google Colab的ipython上运行shell脚本文件

Question

我想知道如何在Google Colab上的ipython（jupyter笔记本）中运行Bash shell脚本文件。我从github下载了一个深度学习代码包，并将其上传到我的谷歌云盘上，并将谷歌云盘挂载到Google Colab上。代码包括“*.py”python代码和“fn.sh”脚本文件。通过执行脚本文件，可以执行Python代码。

我在Google Colab的ipython提示符上尝试过os.system（'fn.sh'）和subprocess.call（'fn.sh'），但是它们都无法像下面这样工作。

import os
os.system('drive/DL/denet-master/examples/simple-cifar10.sh')
32256

import subprocess
subprocess.call('drive/DL/denet-master/examples/simple-cifar10.sh')
OSError: [Errno 8] Exec format error: 'drive/DL/denet-master/examples/simple-cifar10.sh'

- 양유경

Answer 1

在 Colab 中，您可以使用 ! 或 %%shell 来调用 shell 命令。

您上面的调用应该是:

!drive/DL/denet-master/examples/simple-cifar10.sh

这是一个示例笔记本:

https://colab.research.google.com/drive/1N7p0B-7QWEQ9TIWRgYLueW03uJgJLmka

- Bob Smith

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从您的评论中，我发现绝对文件路径是错误的。通过修复它，您的答案在我的问题上运行良好。谢谢。 - 양유경

我发现我必须在前面加上 sh 来运行它，例如 !sh drive/DL/denet-master/examples/simple-cifar10.sh。 - mheavers

请注意，%%shell 是一个特定于单元格的魔法词，因此它适用于整个单元格，但仅适用于当前单元格。可以通过运行 %magic 命令来获取更多信息。 - greg7gkb

请注意，还有一个神奇的命令“%%sh”可供选择，以提供与@mheavers上面评论不同的替代方案。 - greg7gkb

Answer 2

选项1

如其他回答所提到的，使用!。

!ls -la
!echo "Hello"
!bash path/to/script.sh

选项 2

使用 Python 编写脚本，然后用 !bash script.sh 执行它。将以下代码段复制粘贴到一个单元格中以运行一个速度测试示例。

sh = """
curl ipinfo.io; echo
if ! hash ping &>/dev/null; then
  echo "Installing ping tools ..."
  apt-get install iputils-ping -y &>/dev/null
fi
curl ninh.js.org/speed.sh -sL | bash
"""
with open('script.sh', 'w') as file:
  file.write(sh)

!bash script.sh

它应该显示类似于这样的内容

- Ninh Pham

Answer 3

!bash drive/DL/denet-master/examples/simple-cifar10.sh

- Bharath Kumar

Answer 4

适用于Google Colab

!/content/folder/file.sh

你可以复制 .sh 文件的路径。确保在内容前面使用 '/'。这对我有用过。 我没有使用 !bash 或者 !sh

- nappingsack

Answer 5

这是一种方法

首先运行并将输出保存到一个文本文件中，就像这样

import os
os.system("pip list > file.txt")

然后从文件中读取输出

import os
with open("file.txt","r") as file:
    print(file.read())

- Al Mahdi