Cython编译错误：函数重复定义。

Question

我创建了一个名为test.c的c文件，并定义了两个函数，如下所示：

#include<stdio.h>
void hello_1(void){
    printf("hello 1\n");
}
void hello_2(void){
    printf("hello 2\n");
}

接着，我按如下方式创建了test.pyx:

import cython
cdef extern void hello_1()

安装文件如下：

from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext

setup(cmdclass={'buld_ext':build_ext}, 
      ext_modules=[Extension("test",["test.pyx", "test.c"], 
                   include_dirs=[np.get_include()],
                   extra_compile_args=['-g', '-fopenmp'],
                   extra_link_args=['-g', '-fopenmp', '-pthread'])
    ])

当我运行安装文件时，它总是报告hello_1和hello_2有多个定义。有人能告诉我问题出在哪里吗？

- hanqiang

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如果这是你的实际代码，那么至少有两个问题：（1）你拼错了 Extension、build_ext，可能还有其他东西，（2）你有一个名为 test.c 的文件将被从 test.pyx 生成的文件覆盖。 - abarnert

我之前发布的文件并不完全与我所拥有的相同，而且我也犯了一些错别字。我已经纠正了我的问题。我在这里唯一的问题是因为C文件名与Cython自动生成的C文件名相同。谢谢你的帮助。 - hanqiang

Answer 1

您发布的文件存在多个问题，我不知道哪一个会导致您的实际代码出现问题 - 特别是因为您展示的代码不可能产生这些错误。但是如果我解决了所有明显的问题，一切都能正常工作。所以，让我们逐一分析它们：您的setup.py缺少顶部的imports，因此将立即失败并出现NameError错误。接下来，有多个拼写错误 - Extenson应为Extension，buld_ext应为build_ext，我记得还有一个我已经修复了但是不记得了。我删除了与您的问题无关且容易混淆的numpy和openmp内容。当您解决了所有这些问题并实际运行设置时，下一个问题就会立即变得明显：

$ python setup.py build_ext -i
running build_ext
cythoning test.pyx to test.c

您要么在将文件从test.pyx编译生成的文件覆盖test.c文件，或者如果您很幸运，会忽略生成的test.c文件并使用现有的test.c文件作为test.pyx的Cython编译输出。无论哪种方式，您都在两次编译同一文件，并尝试将结果链接在一起，因此出现了多个定义。

您可以将Cython配置为使用非默认名称的文件，或者更简单地遵循通常的命名约定，不要在第一次使用test.c的test.pyx文件中使用该文件。

所以：

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ctest.c:

#include <stdio.h>
void hello_1(void){
    printf("hello 1\n");
}
void hello_2(void){
    printf("hello 2\n");
}

test.pyx:

import cython
cdef extern void hello_1()

setup.py:

from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Distutils import build_ext

setup(cmdclass={'build_ext':build_ext}, 
      ext_modules=[Extension("test",["test.pyx", "ctest.c"], 
                   extra_compile_args=['-g'],
                   extra_link_args=['-g', '-pthread'])
    ])

运行它：

$ python setup.py build_ext -i
running build_ext
cythoning test.pyx to test.c
# ...
clang: warning: argument unused during compilation: '-pthread'
$ python
>>> import test
>>>

哒啦。

- abarnert

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出现多个定义的原因是C文件名与Cython生成的C文件名相同，解决方法是更改C文件名。非常感谢。 - hanqiang