samtools - dyld：库未加载：@rpath/libcrypto.1.0.0.dylib

Question

samtools - dyld：库未加载：@rpath/libcrypto.1.0.0.dylib

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我在其他地方看到过一些类似的问题，但似乎找不到适合我的解决方法。我正在尝试在anaconda上使用python运行samtools。我正在运行macOS Catalina。下面是错误代码：

dyld: Library not loaded: @rpath/libcrypto.1.0.0.dylib
  Referenced from: /Users/me/anaconda3/bin/samtools
  Reason: image not found
zsh: abort      samtools

我已经尝试了各种方式通过Anaconda安装早期版本的openssl，但仍然显示我已经安装了openssl 1.1.1版。

感谢任何关于如何（a）通过Anaconda安装早期版本的openssl或者（b）指导samtools评估不同路径中的早期版本或（c）任何其他解决方案的指导。

- user2416002

你有没有找到任何使用conda的解决方法，而不需要从源代码编译samtools？例如，在使用conda安装samtools时，通过降级依赖项在同一命令行中解决问题？我有类似的问题，但由于整个应用程序（Galaxy）需要它，所以我只能使用基于conda的解决方案。 - Timur Shtatland

1个回答

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原文链接

- user2416002 · Accepted Answer

好的，如果其他人遇到这个问题，我很愿意接受其他解决方案，但这是对我有效的方法。

我从sourceforge（https://sourceforge.net/projects/samtools/）下载了这个包，并按照readme文件中的说明进行了编译。我没有使用anaconda软件包中的samtools，而是将这个新编译的文件移动到需要操作的文件夹中，然后从该文件夹中调用它，如下所示：

cd users/me/desktop/example  (where samtools executable lives in this folder)

./samtools etc etc

我知道对许多人来说这是基础问题，但对我来说不是，我希望这对将来遇到此类问题的任何人都有所帮助。