我需要修改一个现有的APK文件，更改源代码并重新编译它。
但现在我想知道如何重新编译Java文件并将其放回jar文件中！（制作jar文件部分应该很容易，主要问题似乎是如何为Android重新编译Java文件）
我知道另一种方法是使用apktool，然后修改smali文件，但当我们想添加大量代码时，这似乎非常复杂！
我的应用程序是一个基本的HelloWorld，没有混淆。
感谢Chris Jester-Young，我设法让它工作了！
我认为我成功的方法仅适用于非常简单的项目：
使用apktool获取Android清单文件和资源文件。
在Eclipse中创建一个具有与旧项目相同设置的新项目（检查清单文件中的所有信息）
/!\请确保您已从设备中删除了旧apk，否则会引发错误，指出apk签名与旧版不同！
我知道这个问题已经有答案了，但我想传达一个信息，即如何在没有使用dexjar的情况下获取apk的源代码。
有一个在线反编译器适用于Android apk文件：
我不知道这个方法有多可靠。
@darkheir 的回答是手动反编译apk的方法。它帮助我们理解apk创建的不同阶段。
这些链接上有很多广告
另一个在线apk反编译器 @Andrew Rukin ：http://www.javadecompilers.com/apk
仍然值得一试。向创作者致敬。
这些答案已经有点过时或不完整。这可能适用于非受保护的APK（没有Proguard），但现在没有人部署未受保护的APK。我能够修改一个（我的）受到很好保护的APK（Proguard，安全检查，检查“黑客工具”，安全检查，检查应用程序是否以调试模式重新打包等）的方法是使用apktool，正如其他人在这里提到的。但没有人解释，你必须再次对应用程序进行签名。
apktool d app.apk
//generates a folder with smali bytecode files.
//Do something with it.
apktool b [folder name] -o modified.apk
//generates the modified apk.
//and then
jarsigner -verbose -sigalg SHA1withRSA -digestalg SHA1 -keystore ~/.android/debug.keystore modified.apk androiddebugkey
//signs the app the the debug key (the password is android)
//this apk can be installed on a device.
首先从以下链接下载 dex2jar 工具 http://code.google.com/p/dex2jar/downloads/list
解压文件并创建 dex2jar 文件夹
现在选择您的 apk 文件并将其扩展名改为 .zip，然后提取此 zip 文件，您会发现 classes.dex 文件
现在将 classes.dex 文件放入 dex2jar 文件夹中
现在打开 cmd 窗口并键入 dex2jar 文件夹的路径
现在键入命令 dex2jar.bat classes.dex 并按 Enter 键
现在打开 dex2jar 文件夹，您会找到 classes_dex2jar.jar 文件
接下来您可以从以下链接下载 java 反编译工具 http://java.decompiler.free.fr/?q=jdgui
最后一步是在 java 反编译工具中打开 classes_dex2jar.jar 文件，现在您可以看到 apk 代码
我知道这个问题已经有答案了，我不打算在这里给出更好的答案。我只是想分享一下我的经验。
有一次我丢失了代码，但只有 apk 文件。我使用下面的工具对其进行反编译，这让我很开心。
这些工具必须在这种情况下使用，否则是不道德的，甚至有时是非法的（窃取别人的努力）。所以请明智地使用它们。
以下是我最喜欢用于此类操作的工具：
如果您需要从 Google Play 获取 apk 文件，您可以搜索或查看以下网站：
在发布本答案时，我测试了所有链接，对我来说都完美运行。
注意： 在混淆代码的情况下，apk 反编译并不有效。因为 Proguard 会缩小和混淆代码，并将类重命名为无意义的名称，这使得理解代码相当困难。
额外福利：
dex2jar与jd-gui一起使用可以提供所有Java源文件，但它们并不完全相同。它们几乎是等价的.class文件（不是100%）。 因此，如果您想更改apk文件的代码：
使用apktool反编译
apktool将为每个具有相同名称的Java文件生成smali（dex的汇编版本）文件。
smali易于理解，可在相关文件中进行更改，然后使用相同的apktool重新编译（apktool b Nw.apk <Folder Containing Modified Files>）
这是一种方法：
使用 apktool 进行反编译：
$ apktool d -f {apk文件} -o {输出文件夹}
接下来，使用 JADX（在 github.com/skylot/jadx）
$ jadx -d {输出文件夹} {apk文件}
2个工具将提取和反编译到同一输出文件夹。