我正在使用Python将CSV文件中的有向加权图加载到graph-tool图形中。输入CSV文件的组织方式如下:
1,2,300
2,4,432
3,89,1.24
...
其中,每行的前两个条目标识边的源和目标,第三个数字是边的权重。
目前,我正在使用:
1,2,300
2,4,432
3,89,1.24
...
其中,每行的前两个条目标识边的源和目标,第三个数字是边的权重。
目前,我正在使用:
g = gt.Graph()
e_weight = g.new_edge_property("float")
csv_network = open (in_file_directory+ '/'+network_input, 'r')
csv_data_n = csv_network.readlines()
for line in csv_data_n:
edge = line.replace('\r\n','')
edge = edge.split(delimiter)
e = g.add_edge(edge[0], edge[1])
e_weight[e] = float(edge[2])
然而,加载数据需要相当长的时间(我有一张包含1000万个节点的网络图,需要约45分钟)。我尝试通过使用g.add_edge_list来加速,但是它只适用于无权图。请问有什么建议可以让加载速度更快吗?