你能通过R-Reticulate安装Python包吗？

Question

我即将使用Reticulate包在R中创建一个Python接口。为了在R中访问Python函数，需要安装相应的Python包。

我有两个问题：

1）如果使用reticulate包，是否需要安装Anaconda包？还是仅安装Python包就足够了？

2）是否可以在R中安装Python包，类似于install.packages("r_package")？

有没有人在这个主题上有经验？先谢谢了！

- Carmen

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1. "Anaconda" 不是一个软件包，而是一组软件包和其他内容的捆绑包。它们可能存在于任何给定的 Python 安装中，也可能不存在。
2. 你是在问如何安装 Python 软件包吗？比如使用 pip 命令？

- Spacedman

1. 我想知道是否可以安装单个软件包，例如XLWings，并通过Reticulate在R中使用它，而无需在计算机上安装Anaconda。
2. 在R中安装软件包只需要“install.packages（“r-package”）”。在我的情况下，我想安装xlwings，但不是通过pip install xlwings，而是直接在R中安装。这可能吗？

- Carmen

如果你在调用R的Python中有pip模块，你可以使用它来安装Python模块。 - Spacedman

Answer 1

我会对之前的答案进行一些微调。正如@f0nzie所说，Anaconda不是一个软件包，而是一个软件包管理器。理想情况下，您应该使用Anaconda创建一个环境来协助您进行软件包管理和版本控制。有关conda环境的文档可以在这里找到。

现在，在R中可以通过reticulate::conda_install(envname, packages)向Anaconda软件包安装Python软件包。有关conda_install()的文档可以在这里找到。

- Dale Jacques

Answer 2

1) R包reticulate可以与默认的Python或Anaconda2或Anaconda3一起使用。如果您想让Anaconda与R一起工作，您需要先安装Anaconda。安装完成后，您调用library(reticulate)并运行py_config()或reticulate::py_discover_config()，这将给出Python安装所使用的路径和环境列表。然后，一旦您知道Python路径，您在library(reticulate)之后添加像这样的一行： use_python("/opt/miniconda2/bin/python")，就可以开始工作了。

2) 要安装Python包以便R（或reticulate）可以看到它们，您必须从终端或控制台安装它们作为常规的Python包。例如：conda install numpy来安装numpy，或conda install scipy来安装scipy等。

我只是在Docker容器rocker/rstudio中进行所有操作。在标准操作系统中应该更容易。

以下是逐步说明：rstudio reticulate

干杯！

- f0nzie

Answer 3

如果您需要特定版本的Python模块，那么请在模块名称后加上 ==，例如，以下命令将使用pip安装3个特定版本的模块：

reticulate::conda_install(c("PyMuPDF==1.14.20", "PyPDF2==1.26.0", "reportlab==3.5.23"),
                            envname = "myenv", pip = TRUE)

- Edgar Manukyan