Gephi 0.9.1版本缺少Neo4j插件。

Question

我对neo4j还不太熟悉。在我的图表中，有超过5千个节点，但是neo4j浏览器并没有显示所有的节点，似乎存在限制，而且图片也很混乱。 所以我尝试使用gephi 0.9并安装了它。 但是我找不到neo4j数据库插件。我检查了 工具-->插件-->可用插件部分。

如果我漏掉了什么，请告诉我。 插件截图 提前感谢。

- learn_more

Answer 1

“实际上，您不需要使用Neo4j插件来使用Gephi，可以使用neo4j-shell-tools进行GraphML导出并在Gephi中打开。

请注意，export-graphml选项解析有点问题（我应该为它打开一个问题）; 如果要使用-t或-r标志，必须在-o之前指定，如下所示：”

export-graphml -r -o out.graphml match ...

我还需要向GraphML文件添加一些元数据描述，以便Gephi找到更多的数据（至少对于通用元数据，我也应该开一个问题）。文件开头看起来像这样：

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<graphml xmlns="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns http://graphml.graphdrawing.org/xmlns/1.0/graphml.xsd">
<graph id="G" edgedefault="directed">

我改成了

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<graphml xmlns="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns http://graphml.graphdrawing.org/xmlns/1.0/graphml.xsd">
<key attr.name="label" attr.type="string" for="node" id="labels"/>
<key attr.name="label" attr.type="string" for="edge" id="label"/>
<key attr.name="someProperty" attr.type="boolean" for="node" id="someProperty"/>
<!-- more descriptions of node properties -->
<graph id="G" edgedefault="directed">

- Frank Pavageau

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嗨，我对Unix的专业知识不是很熟悉，所以我在这方面遇到了一些困难。我已经下载了zip文件并将其解压缩到lib文件夹中。现在当我尝试运行export-graphml -r -o out.graphml "[MATCH (n:U)-[r:ACCESS]->(p:P) return n,r,p]"时，我得到一个错误，说找不到export-graphml命令。我们需要从neo4j shell运行吗？我正在使用neo4j CE 3.3版本。https://neo4j.com/developer/kb/using-neo4j-shell-neo4j-ce-3x/ 这里有我漏掉的东西吗？ - learn_more

我也尝试在Neo4j shell中运行，但是仍然出现相同的错误。 - learn_more

是的，你必须从neo4j-shell中运行它。如果你在使用过程中遇到问题，可以创建一个新的问题，并详细说明哪些部分出现了问题（如：neo4j-shell本身、在neo4j-shell中导出图形等）。 - Frank Pavageau