Jupyter笔记本：安装R包时出错

Question

Jupyter笔记本：安装R包时出错

rubuntuinstallationjupyter-notebooklibstdc++

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我正在使用Ubuntu 16.04。

我在Jupyter笔记本上运行R，并且所有随"R essentials"安装的包都可以正常工作。

但是，当我尝试安装其他包，例如"mice"或"bigmemory"时，安装总是失败。当它尝试执行

**测试已安装的包是否可以加载

就会出现以下错误信息：

Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : unable to load shared object '/home/usr/anaconda3/lib/R/library/bigmemory/libs/bigmemory.so': /home/usr/anaconda3/lib/R/library/Rcpp/libs/../../../../libstdc++.so.6: version 'GLIBCXX_3.4.20' not found (required by /home/usr/anaconda3/lib/R/library/bigmemory/libs/bigmemory.so)

我尝试过 sudo apt-get install libstdc++6，并且它显示我的libstdc++6已安装，并且已经是最新版本。我不知道为什么R安装程序找不到它。

- Ran Cui

1个回答

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可以查看英文原文，
原文链接

- Ran Cui · Accepted Answer

我想通了！

我感到沮丧，完全卸载了anaconda3 rm -rf ~\anaconda3。重新安装后，我查看了安装IRkernel的说明。我看到这个：

如果失败，请在输出中搜索类似以下内容：

** testing if installed package can be loaded Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : unable to load shared object '/Users/[you]/anaconda/lib/R/library/rzmq/libs/rzmq.so': dlopen(/Users/[you]/anaconda/lib/R/library/rzmq/libs/rzmq.so, 6): Library not loaded: libzmq.5.dylib Referenced from: /Users/[you]/anaconda/lib/R/library/rzmq/libs/rzmq.so Reason: image not found

这意味着rzmq的R二进制包是使用与您系统上的不同版本的libzmq编译的。它可以通过从源代码安装来修复。

所以按照说明，我做了以下操作：install.packages('mice','/home/[usr]/anaconda3/lib/R/library/',type = 'source') 它成功了！我对“bigmemory”也做了同样的事情。现在没有错误消息，我可以在Jupyter笔记本上同时使用它们了。