使用PIL将numpy数组保存为TIFF序列

Question

我看到了一个加载TIFF序列（例如3D TIFF堆栈或动画）的示例。然而，我无法想出如何将3D + numpy数组保存为TIFF序列。是否有任何编码的示例？我可以使用PIL.fromarray读取2D数组。如果这种方法能够加载多维数组就更好了，但是幼稚的方法调用会抛出不支持类型的异常。

假设如果有人编写了这样的序列，他们可能还想添加一些标头来指定通道、时间等。我的特别偏见在于能够在像ImageJ/FIJI这样的应用程序中打开这些图像或从TIFF转换为其他格式。也许有更好的方法首先解决这个问题。

- ismisesisko

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谢谢。是的，我已经使用了tifffile并且它确实可以工作，但我还是很想尝试使用PIL。tifffile.py路线没有任何问题-它运行良好并且代码有很好的注释。当我使用CZIFile时遇到了这个问题，它（如您所知）使用tifffile。 - ismisesisko

你有没有找到在PIL中保存tiff堆栈的解决方案？我肯定会感兴趣！ :) - Richard

嗨Richard，很抱歉我没有找到有关PIL的任何信息，而且自从那时起我也没有再去看过。事实上，这些日子里，我想我也是在使用skimage.io来读取TIFF堆栈，所以我最近并没有专注于PIL。能否使用skimage.io保存TIFF堆栈？我现在脑子里不确定... - ismisesisko

Answer 1

我知道这很老，但如果有人在这里寻找答案，这似乎已经得到了很好的解决。

例如。

im.save("filename.tiff", format="TIFF", save_all=True)

https://pillow.readthedocs.io/en/latest/releasenotes/3.4.0.html

- Alex Crocker