虚拟环境中的引用损坏

Question

我最近在我的 Mac 上安装了一堆 dotfiles 和其他应用程序（我改用 iTerm 代替 Terminal，并将 Sublime 设置为默认文本编辑器），但自从那时起，我的所有虚拟环境都停止工作了，尽管它们在 .virtualenvs 文件夹内仍然存在，但每当我尝试在其中运行任何内容时，它们都会给出以下错误：

dyld: Library not loaded: @executable_path/../.Python
  Referenced from: /Users/[user]/.virtualenvs/modclass/bin/python
  Reason: image not found
Trace/BPT trap: 5

我已经删除了与dotfiles相关的所有文件，并将我的.bash_profile还原为之前的状态，但问题仍然存在。有没有办法诊断问题或以简单的方式解决它（例如，不需要重新创建所有虚拟环境）？

- oxtay

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可能相关：http://debugfix.com/2011/11/dyld-library-loaded-executable_path-python/ - unutbu

感谢您的评论，@unubtu。这确实很有帮助。但是我也无法创建任何新的虚拟环境。我的 rmvirtualenv 仍然有效，但是当尝试运行 mkvirtualenv 时，我会收到以下错误：`-bash: /usr/local/bin/virtualenv: /usr/local/Cellar/python/2.7.6/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Resour: bad interpreter: No such file or directory`因此，似乎存在我的 Python 路径问题，但我看不到问题所在，因为我可以运行 Python，而且它似乎很正常。 - oxtay

[更新] 我可能已经找到了问题，但我不确定该如何解决。理论上，所有的 virtualenv 命令都可以工作，但由于 Python 存在问题，它们并没有起到任何作用。所以真正的问题在于 brew 的 Python。我怀疑原因是 Python 目录名称的更改。由于某种原因，所有这些命令都在寻找 /usr/local/Cellar/python/2.7.6 文件夹中的 Python，但实际上文件夹的名称是 /usr/local/Cellar/python/2.7.6_1。 - oxtay

由于我是个新手，我不知道手动将名称从2.7.6_1更改为2.7.6会有多大的风险，也不知道会发生什么。 - oxtay

不幸的是，损坏的链接对我没有起作用。通过@oxtay的解决方案，我能够解决“错误的解释器”问题，方法是创建一个名为/usr/local/Cellar/python/2.7.6的新目录（mkdir），并将/usr/local/Cellar/python/2.7.9中的所有文件复制（cp -r）到该文件夹中。我太紧张了，不敢只是重命名文件夹！ - Patrick Williams

Answer 1

我在这里找到了解决问题的方法，所以所有的功劳归于作者。

要点是，在创建一个虚拟环境时，会创建许多指向Homebrew安装的Python的符号链接。

以下是一个例子：

$ ls -la ~/.virtualenvs/my-virtual-env
...
lrwxr-xr-x  1 ryan staff   78 Jun 25 13:21 .Python -> /usr/local/Cellar/python/2.7.7/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Python
...

еҪ“дҪ дҪҝз”ЁHomebrewеҚҮзә§Python并иҝҗиЎҢ`brew cleanup`ж—¶пјҢиҷҡжӢҹзҺҜеўғдёӯзҡ„з¬ҰеҸ·й“ҫжҺҘдјҡжҢҮеҗ‘дёҚеҶҚеӯҳеңЁзҡ„и·Ҝеҫ„пјҲеӣ дёәHomebrewе·Іе°Ҷе®ғ们еҲ йҷӨпјүгҖӮ

иҝҷдәӣз¬ҰеҸ·й“ҫжҺҘйңҖиҰҒжҢҮеҗ‘ж–°е®үиЈ…зҡ„Pythonпјҡ

lrwxr-xr-x  1 ryan staff   78 Jun 25 13:21 .Python -> /usr/local/Cellar/python/2.7.8_1/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Python

解决方法是删除virtualenv中的符号链接，然后重新创建它们：

find ~/.virtualenvs/my-virtual-env/ -type l -delete
virtualenv ~/.virtualenvs/my-virtual-env

在删除链接之前，最好先检查哪些链接将被删除：

find ~/.virtualenvs/my-virtual-env/ -type l

在我看来，仅删除损坏的符号链接甚至更好。您可以使用GNU find来执行此操作：

gfind ~/.virtualenvs/my-virtual-env/ -type l -xtype l -delete

您可以使用Homebrew安装GNU find，如果您还没有它的话：

brew install findutils

请注意，默认情况下，通过Homebrew安装的GNU程序往往会以字母

- Ryan Kaskel

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+1 gfind 很完美，因为我有很多未中断的符号链接（例如nodeenv），我不想删除它们。 - 2Toad

另一种去除损坏符号链接的方法是使用标准的 find 命令：find -L ~/.virtualenvs/my-virtual-env/ -type l | xargs rm。 - vdboor

这些步骤对我来说并没有完全起作用：pip3 freeze dyld：lazy symbol binding failed: Symbol not found: __Py_UnixMain。 - deed02392

只是补充一下，如果环境使用的是Python 2，请使用参数运行它：virtualenv ~/.virtualenvs/foo -p python2，否则它会使用Python 3。 - Bohumir Zamecnik

非常感谢。删除符号链接并重新创建虚拟环境解决了问题。干得好。 - user2233949

Answer 2

在尝试了一些方法后，这个对我奏效：

前往您的虚拟环境目录（但不要运行workon）：

cd ~/.virtualenv/name_of_broken_venv

现在删除这些文件：

rm -rf .Python bin/python* lib/python2.7/* include/python2.7

然后重新构建您的虚拟环境，请运行：

virtualenv .
workon name_of_broken_venv
pip freeze

现在您应该再次看到您安装的软件包列表。

- Chris Wedgwood

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顺便说一句，我刚刚尝试了这种方法，在升级到El Capitan并重新安装homebrew后，我的软件包列表没有被保留。 - Ryan

使用pipenv，您可以通过执行pipenv --rm来删除并重新创建环境，使用pipenv shell进入虚拟环境，使用pipenv install安装依赖包。 - Harry Moreno

如果你遇到了与 virtualenvwrapper.sh: There was a problem running the initialization hooks 相关的错误，你需要执行 pip install virtualenv virtualenvwrapper 或者 pip3 install virtualenv virtualenvwrapper 来重新同步所有内容。 - cybertoast

Answer 3

我从Snow Leopard升级到Mac OS X Mavericks时遇到了这个问题。我需要在更新之前重新安装brew。希望您已经对pip的项目运行了freeze命令。

要解决这个问题，您需要更新虚拟环境指向的路径。

• 使用brew安装Python：

brew install python

• 重新安装virtualenvwrapper：

pip install --upgrade virtualenvwrapper

• 删除旧虚拟环境：

rmvirtualenv old_project

• 创建新的虚拟环境：

mkvirtualenv new_project

• 使用新的虚拟环境：

workon new_project

• 使用pip为新项目安装所需的库。

pip install -r requirements.txt

这样做应该会使项目恢复原状。

- Robert Brisita

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这是一段时间以前的事情了，我相信最终我做了类似的事情，但由于当时我没有运行 'pip freeze > requirements.txt'，所以它不是最有效的解决方案。吸取了教训。 - oxtay

Answer 4

@Chris Wedgwood的一个更新版本，用于保留site-packages（保留已安装的软件包）

cd ~/.virtualenv/name_of_broken_venv


mv lib/python2.7/site-packages ./    
rm -rf .Python bin lib include
virtualenv .
rm -rf lib/python2.7/site-packages
mv ./site-packages lib/python2.7/

- WeizhongTu

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这已经超越完美了。它可以帮助迁移Python版本并保留所有软件包。如果您正在遵循此操作，请不要执行@Chris Wedgewood的指示。 - Harish Prasanna

Answer 5

似乎解决此问题的正确方法是运行：

 pip install --upgrade virtualenv

在使用Homebrew升级Python之后，按照以下步骤操作即可。这些步骤适用于任何需要安装像Python这样拥有自己的软件包管理系统的公式。当你执行brew install python命令时，你会安装python、pip、easy_install、virtualenv等工具。因此，如果这些工具可以自行更新，最好尝试自行更新它们，而不是将Homebrew作为问题源头。

- Nate

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这对于setuptools的问题有效，具体来说是：警告：无法找到setuptools == 0.6c12dev-r88846的svn位置。 - Robert Brisita

我采用了这个解决方案，然后在我的破损虚拟环境中运行了以下命令：virtualenv .更新后的 virtualenv 版本重新创建了必要的依赖项，然后一切都正常了。对我来说，这个过程比被接受的答案更自主和健壮。 - christang

在2020年，这仍然是答案。 - scubabuddha

Answer 6

如果这是由于brew upgrade升级了Python引起的，并且您打算降级到先前的版本，请尝试brew switch python [previous version]，例如brew switch python 3.6.5。详情请见此处。

- ryan

Answer 7

任何使用pipenv（你应该使用！）的人都可以直接使用这两个命令，无需启用虚拟环境：

rm -rf `pipenv --venv` # remove the broken venv
pipenv install --dev   # reinstall the venv from pipfile 

- Robbotnik

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你也可以在你的环境文件夹中使用 pipenv --rm 命令，然后执行 pipenv install --dev 安装依赖。 - Handfeger

Answer 8

virtualenvwrapper指南

如接受的答案所示，根本原因可能是homebrew更新导致您的虚拟环境符号链接指向损坏的python路径 - 详情请参见此处。

对于每个虚拟环境，您需要重新分配符号链接以指向正确的python路径（在brew cellar中）。以下是使用virtualenvwrapper的方法。这里我正在更新名为“my-example-env”的虚拟环境。

cd ~/PYTHON_ENVS
find ./my-example-env -type l -delete
mkvirtualenv my-example-env

所有操作完成。

- arcseldon

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不可移植（BSD find） - sorin

Answer 9

我的问题是(brew)更新了Python和虚拟环境的链接到已删除的旧版本，这对我(一名MacOS用户)来说是个问题。

我们可以通过以下方式检查并修复它：

>> ls -al ~/.virtualenvs/<your-virtual-env>/.Python
.Python -> /usr/local/Cellar/python/<old-version>/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/Python
>> rm ~/.virtualenvs/<your-virtual-env>/.Python
>> ln -s  /usr/local/Cellar/python/<new-version>/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/Python ~/.virtualenvs/<your-virtual-env>/.Python

- Yihe

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这也适用于在已安装Python3.6的系统上安装Python 3.7后修复损坏的链接。 - lukik

Answer 10

我遇到了类似的问题，只需使用 virtualenv . 重新构建虚拟环境即可解决问题。

- dorinjj

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欢迎来到SO。虽然我们感谢您的回答，但如果它在其他答案的基础上提供了额外的价值，那么就更好了。在这种情况下，由于另一位用户已经发布了那个解决方案，因此您的答案并没有提供附加值。如果以前的答案对您有帮助，您应该在获得足够的声望后投票支持它。 - David Buck