在启动时运行的bash脚本中激活conda环境

Question

我有一个生成动画的Python脚本，它需要在一个conda环境中安装的库。我需要让这个脚本在我的电脑开机后立即运行，所以我编写了一个简短的Bash脚本，并将其添加到“启动应用程序”中。这个Bash脚本会在启动时运行，内容如下：

#!/bin/bash

conda activate myenv
cd ~/scripts
python generate.py

当我在终端上运行它时，一切正常，但每当我打开电脑时，Python脚本部分不会执行，并且当我检查错误时，我发现：

conda: command not found

然后我发现Python脚本无法运行，因为它缺少库（conda环境未激活）。我尝试在bash脚本中添加代码行，将"conda activate"替换为"source activate"，我还尝试在bash脚本中添加echo ". /home/<user>/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" >> ~/.bashrc，将"conda"替换为/home/barrat/anaconda3/bin/conda，甚至在启动时添加whoami到bash脚本中，以确保我没有偶然成为root用户...但这些都没有起作用。非常感谢任何帮助，现在是凌晨3点，我有点绝望。

- Robbie Barrat

Answer 1

您可能已经解决了这个问题，但是对于未来的观众，这对我有用:

if [ -f "/path/to/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
    . "/path/to/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"
    CONDA_CHANGEPS1=false conda activate myenv
fi

将其替换为 source activate myenv。

- gwido

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这对我有用。实际上很难找到这个解决方案！ - Denis

如果您已经初始化了Anaconda环境并且终端以“(base)”开头，则无需使用“CONDA_CHANGEPS1=false”。 - Vitali Avagyan

Answer 2

既然您正在尝试激活环境以启动脚本，那么您也可以使用Python的subprocess模块自己制作启动脚本来执行所需的任务。

尝试创建一个名为demo.py的脚本：

import os
import system
import subprocess
import x

subprocess.run(["command name", "value"]) #for all scripts you want to execute

然后，您可以将此Python脚本放置在启动时运行。 您可以启动相当多的操作，而不会对系统速度产生明显的影响，并且始终可以通过在两个调用之间使用time.sleep()来逐个启动进程并轻松监视它。

- Ashwin Phadke

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抱歉 - 我认为你误解了。我有一个脚本想要在启动时运行 - 我的问题是我无法激活包含此脚本所需库的conda环境。 - Robbie Barrat

你尝试过将conda环境及其Python添加到操作系统的“PATH”中吗？如果无法找到conda的安装，它将无法从“python”到其库中找到任何内容。 - Ashwin Phadke