当knitr需要下载zip文件时出错

Question

由于与网络安全系统冲突，我只能通过R本身下载数据文件到网络中可用于R的区域。当我在RStudio中运行脚本时，它可以正常工作。但是当我尝试编织脚本时，我会收到"Unsupported URL"消息。

Error in file(file, "rt") : cannot open the connection 
Calls: <Anonymous> ... withVisible -> eval -> eval -> read.csv -> 
    read.table -> file
Execution halted

以下是在正常运行时可以工作但在编织过程中无法工作的代码。

url <- "https://d396qusza40orc.cloudfront.net/repdata%2Fdata%2Factivity.zip"
download.file(url, "repdata-data-activity.zip")
unzip("repdata-data-activity.zip")

如果文件不是zip格式，我可以使用RCurl下载，但是当我尝试这样做时，R崩溃了。我也尝试了 method = "curl"，setInternet2(TRUE)，并尝试从https中删除s，但都没有成功。

结果是我无法生成一个正常的文档，这是个问题。我之前遇到过非常类似的问题（CSV文件而不是压缩的CSV文件，请参见下面的链接），并尝试了建议，但没有成功: R produces "unsupported URL scheme" error when getting data from https sites 我正在使用Windows 7和RStudio。

重申一下：只有在编织文档时才会出现这个问题，运行脚本时没有问题。

- Jonno Bourne

Answer 1

问题在于https以及文件是二进制的。通过将URL更改为http并将file.download设置为mode="wb"，问题得到解决，脚本可以成功地编织。

最终代码块如下：

url <- "http://d396qusza40orc.cloudfront.net/repdata%2Fdata%2Factivity.zip"
download.file(url, "repdata-data-activity.zip", mode="wb")
unzip("repdata-data-activity.zip")

- Jonno Bourne