我也遇到了这个问题，下面是我是如何解决的。
问题的基础
简单来说，Ubuntu 16中的文件布局改变了plymouth主题的位置，从/lib/plymouth/themes变为/usr/share/plymouth/themes，因此所有假设先前布局的主题安装脚本现在都安装到了错误的位置。因此，当update-initramfs运行时，源数据不在它应该在的位置，导致了这个错误。
plymouth module "(/usr/lib/i386-linux-gnu/plymouth//.so)" missing, skipping that theme
由于这个原因，主题没有安装。备用方案是默认的
ubuntu logo主题。
修复问题
我发现手动操作很方便，而且你对Ubuntu很熟悉，所以我会重点描述方法，而不是提供复制粘贴的方式。
部分初始化和修正apt-get
运行以下命令，它不仅会将一些新主题安装到正确的位置，还会修复现在不正确的
update-alternatives方案。
apt-get install plymouth-themes
运行后，将在/usr/share/plymouth/themes创建一个新的目录结构，其布局与以前的路径完全相同。
迁移旧主题
考虑是否值得迁移每个主题，如果存在重复，则使用已安装的主题。
ls -ltrd /lib/plymouth/themes
ls -ltrd /usr/share/plymouth/themes
迁移到新位置很简单；只需将目录移动，因为每个主题都包含在以主题命名的目录中。
cd /lib/plymouth/themes
mv <theThemeDirectory> /usr/share/plymouth/themes
修复旧主题
旧主题是自我引用的，因为.plymouth主题文件包含对安装主题的目录的引用。将这些引用更改为正确的引用（例如：vi /usr/share/plymouth/themes/orb/orb.plymouth，然后将/lib/plymouth替换为/usr/share/plymouth）。
使用update-alternatives更新列表
以orb示例为基础，使用update-alternatives使主题列表可选择。
update-alternatives --install /usr/share/plymouth/themes/default.plymouth default.plymouth /usr/share/plymouth/themes/orb/orb.plymouth 100
这样做的好处是利用了大多数
gnome-look主题中附带的
update-plymouth脚本。我会包含这段文字。
#!/bin/bash
echo "Choose the number of the theme you want to use, then [ENTER]"
echo
sudo update-alternatives --config default.plymouth
sudo update-initramfs -u
echo
read -p "Do you want to test the theme? (Y/N) "
if [ "$REPLY" != "n" -a "$REPLY" != "N" ] ; then
echo
echo "Running 10-second test..."
sudo plymouthd ; sudo plymouth --show-splash ; for ((I=0; I<10; I++)); do sleep 1 ; sudo plymouth --update=test$I ; done ; sudo plymouth --quit
fi
exit
运行
update-plymouth将允许您选择所需的主题，自动构建新的initramfs并预览它。
额外福利：使用来自deviantart的艺术作品
有了这个知识，我们不必盲目运行安装程序，而是要明白安装新主题只需要以下步骤：
- 将主题目录复制到
/usr/share/plymouth/themes
- 按照上述描述运行
update-alternatives
- 运行
update-plymouth
这样我们就可以访问更多的主题选择，其中我认为
这个声音主题是最好的。
sudo update-initramfs -u返回W: plymouth module "(/usr/lib/i386-linux-gnu/plymouth//.so)" missing, skipping that theme.的错误信息。我查看了与解决方案帖子中链接的问题列表，但没有一个能回答我的问题。不行。sudo reboot后，仍然是旧的启动画面。 - Ram the Cowy